Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PS18

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PS18 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PS18 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PS18 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PS18 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PS18 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PS18 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PS18 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PS18 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PS18 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1W2PS18 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PS18 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PS18 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PS18 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PS18 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PS18 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PS18 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PS18 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PS18 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PS18 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PS18 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1W2PS18 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PS18 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PS18 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PS18 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PS18 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PS18 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PS18 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PS18 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PS18 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PS18 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PS18 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A1W2PS18 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A1W2PS18 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PS18 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PS18 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PS18 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PS18 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A1W2PS18 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A1W2PS18 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A1W2PS18 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A1W2PS18 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A1W2PS18 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A1W2PS18 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A1W2PS18 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A1W2PS18 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A1W2PS18 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A1W2PS18 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A1W2PS18 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A1W2PS18 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A1W2PS18 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A1W2PS18 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A1W2PS18 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A1W2PS18 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A1W2PS18 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A1W2PS18 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms