Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPQ1

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPQ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPQ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPQ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPQ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPQ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPQ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPQ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPQ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPQ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPQ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPQ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PPQ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPQ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPQ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPQ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPQ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPQ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPQ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PPQ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PPQ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PPQ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PPQ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PPQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1W2PPQ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PPQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPQ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPQ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPQ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PPQ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A1W2PPQ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A1W2PPQ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A1W2PPQ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A1W2PPQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A1W2PPQ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A1W2PPQ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A1W2PPQ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A1W2PPQ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A1W2PPQ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A1W2PPQ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A1W2PPQ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A1W2PPQ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms