Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
A0A0U1RRA0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
A0A0U1RRA0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A0A0U1RRA0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A0A0U1RRA0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A0A0U1RRA0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A0A0U1RRA0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A0A0U1RRA0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RRA0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A0A0U1RRA0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A0A0U1RRA0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
A0A0U1RRA0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
A0A0U1RRA0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
A0A0U1RRA0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A0A0U1RRA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A0A0U1RRA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A0A0U1RRA0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A0A0U1RRA0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A0A0U1RRA0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A0A0U1RRA0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
A0A0U1RRA0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A0A0U1RRA0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0U1RRA0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A0A0U1RRA0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A0A0U1RRA0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
A0A0U1RRA0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A0A0U1RRA0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
A0A0U1RRA0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A0A0U1RRA0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms