Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBV2A0A0J9YWF9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBV2A0A0J9YWF9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBV2A0A0J9YWF9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBV2A0A0J9YWF9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBV2A0A0J9YWF9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRBV2A0A0J9YWF9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBV2A0A0J9YWF9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV2A0A0J9YWF9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV2A0A0J9YWF9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV2A0A0J9YWF9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV2A0A0J9YWF9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBV2A0A0J9YWF9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBV2A0A0J9YWF9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBV2A0A0J9YWF9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBV2A0A0J9YWF9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBV2A0A0J9YWF9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV2A0A0J9YWF9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV2A0A0J9YWF9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV2A0A0J9YWF9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV2A0A0J9YWF9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV2A0A0J9YWF9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV2A0A0J9YWF9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV2A0A0J9YWF9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBV2A0A0J9YWF9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBV2A0A0J9YWF9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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