Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1V2

IGHV2-26, Immunoglobulin heavy variable 2-26, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV2-26A0A0B4J1V2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV2-26A0A0B4J1V2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV2-26A0A0B4J1V2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV2-26A0A0B4J1V2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV2-26A0A0B4J1V2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV2-26A0A0B4J1V2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV2-26A0A0B4J1V2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV2-26A0A0B4J1V2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV2-26A0A0B4J1V2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV2-26A0A0B4J1V2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV2-26A0A0B4J1V2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV2-26A0A0B4J1V2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV2-26A0A0B4J1V2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV2-26A0A0B4J1V2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV2-26A0A0B4J1V2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV2-26A0A0B4J1V2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV2-26A0A0B4J1V2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms