Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6U6

TRAV8-7, T-cell receptor alpha variable 8-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-7A0A075B6U6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAV8-7A0A075B6U6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAV8-7A0A075B6U6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAV8-7A0A075B6U6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAV8-7A0A075B6U6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAV8-7A0A075B6U6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV8-7A0A075B6U6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV8-7A0A075B6U6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV8-7A0A075B6U6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV8-7A0A075B6U6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV8-7A0A075B6U6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV8-7A0A075B6U6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV8-7A0A075B6U6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAV8-7A0A075B6U6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV8-7A0A075B6U6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAV8-7A0A075B6U6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAV8-7A0A075B6U6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAV8-7A0A075B6U6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAV8-7A0A075B6U6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAV8-7A0A075B6U6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAV8-7A0A075B6U6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAV8-7A0A075B6U6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAV8-7A0A075B6U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAV8-7A0A075B6U6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAV8-7A0A075B6U6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAV8-7A0A075B6U6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAV8-7A0A075B6U6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAV8-7A0A075B6U6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAV8-7A0A075B6U6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAV8-7A0A075B6U6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAV8-7A0A075B6U6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAV8-7A0A075B6U6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAV8-7A0A075B6U6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAV8-7A0A075B6U6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAV8-7A0A075B6U6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAV8-7A0A075B6U6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAV8-7A0A075B6U6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAV8-7A0A075B6U6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAV8-7A0A075B6U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAV8-7A0A075B6U6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAV8-7A0A075B6U6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAV8-7A0A075B6U6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAV8-7A0A075B6U6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAV8-7A0A075B6U6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAV8-7A0A075B6U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAV8-7A0A075B6U6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAV8-7A0A075B6U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAV8-7A0A075B6U6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAV8-7A0A075B6U6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAV8-7A0A075B6U6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAV8-7A0A075B6U6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAV8-7A0A075B6U6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAV8-7A0A075B6U6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAV8-7A0A075B6U6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAV8-7A0A075B6U6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAV8-7A0A075B6U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAV8-7A0A075B6U6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAV8-7A0A075B6U6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAV8-7A0A075B6U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAV8-7A0A075B6U6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAV8-7A0A075B6U6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms