Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms