Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms