Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCSER1Q9C0I3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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