Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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AMBRA1Q9C0C7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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AMBRA1Q9C0C7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMBRA1Q9C0C7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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AMBRA1Q9C0C7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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AMBRA1Q9C0C7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AMBRA1Q9C0C7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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AMBRA1Q9C0C7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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