Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms