Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGF29Q96ES7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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