Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms