Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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