Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms