Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms