Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FXNQ16595 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FXNQ16595 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms