Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ACKR1Q16570 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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