Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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