Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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