Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNTB2Q13425 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms