Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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