Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms