Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX1P78337 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX1P78337 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PITX1P78337 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms