Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GJA9P57773 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms