Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms