Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETV4P43268 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms