Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP3P42574 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP3P42574 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP3P42574 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms