Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADLP28330 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACADLP28330 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms