Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BGNP21810 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BGNP21810 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BGNP21810 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BGNP21810 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BGNP21810 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BGNP21810 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BGNP21810 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BGNP21810 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BGNP21810 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BGNP21810 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms