Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3JO75822 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3JO75822 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms