Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYNGR2O43760 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms