Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6BO15054 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms