Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM5B3KS81 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms