Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms