Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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