Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCMF1Q9P0J7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms