Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT84Q9NSB2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT84Q9NSB2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KRT84Q9NSB2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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KRT84Q9NSB2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KRT84Q9NSB2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KRT84Q9NSB2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRT84Q9NSB2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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