Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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CHCHD7Q9BUK0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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CHCHD7Q9BUK0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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CHCHD7Q9BUK0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CHCHD7Q9BUK0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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