Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TINF2Q9BSI4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms