Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AGAP3Q96P47 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms