Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RNF183Q96D59 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF183Q96D59 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms