Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG2

C7orf57, Uncharacterized protein C7orf57, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf57Q8NEG2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C7orf57Q8NEG2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms