Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TTC29Q8NA56 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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