Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms