Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms