Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF212Q495C1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms