Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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