Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAPQ14761 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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