Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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